知网查重文件有密码的原因主要是为了保护文档的隐私和安全。在进行知网查重时，有些文件可能包含个人隐私信息或机密内容，为了防止泄露，设置密码是一种有效的保护措施。此外，有密码的文件可以限制非授权人员的访问，确保文件的完整性和保密性。因此，知网查重文件有密码是为了维护文件的安全性和保密性。

知网查重文件有密码的原因还包括防止他人恶意篡改文件内容，避免文件被恶意下载和传播，以及保护知识产权不受侵犯。通过设置密码，可以有效防止他人未经授权的使用和传播文件，确保作者的权益不受损害。此外，对于一些重要的学术研究资料或商业文件，设置密码还可以防止泄密和不当使用，提高文件的安全性和可信度。因此，知网查重文件有密码是为了维护知识产权和保障文件的合法使用。